小产权房并不是一个法律概念，其泛指在农村集体土上建设的房屋，因其土地性质一般为集体土地而非商业用地，故无法通过正常审批手续办理产权证。

而同时国家对小产权房的流转有诸多限制，所以小产权房的分割是离婚财产分割中的一个难点问题。

通常来说，小产权房无法办理产权证，属于未取得所有权的房屋。而夫妻双方在离婚时，只能分割已经取得所有权的共同财产，所以一般情形下，法院在判决时不会处理小产权房的所有权归属问题。

但根据《婚姻法司法解释二》第二十一条第一款规定，离婚时双方对尚未取得所有权或者尚未取得完全所有权的房屋有争议且协商不成的，人民法院不宜判决房屋所有权的归属，应当根据实际情况判决由当事人使用。因此，法院虽然无法判决小产权房归谁所有，但理论上法院可以判定小产权房由谁居住使用，双方可以通过协商、竞价等方式取得房屋使用权。

而对于未能取得使用权的一方来说，其可以要求一些补偿，补偿的具体数额可以由双方进行协商，如果协商不成也可以申请法院对使用权进行评估或者由法院酌情判定。但是在实务中，由于小产权房尚缺乏合法性，故法院出于慎重考虑，多数情况下会选择对该房屋暂不予处理。

不过小产权房具体情况复杂，有些小产权房可能已经被有关机关认定为属违法建筑，而有些小产权房可能已经通过相关行政程序合法化。

其中，对于已经被有权机关认定为是违法建筑的小产权房，法院是无法处理的。因为一旦法院在判决中就违法建筑的所有权或者使用权进行处理，便会涉嫌通过判决将违法建筑合法化的问题，这势必会扰乱国家对土地的管理秩序，影响社会稳定。而对于已经合法化的小产权房，法院可以按照处理共同财产的一般原则，就所有权归属作出处理。